中国农业科学院农田灌溉研究所1959年成立于北京，1963年搬迁到河南省新乡市，由农业农村部、水利部共同领导，三权归属中国农业科学院。主要从事农田灌溉排水科技领域的应用基础研究、技术创新技术推广工作，研究方向主要包括农田灌溉排水技术与装备、作物-水关系及作物高效用水技术、农业水资源合理利用与水环境保护、农田生态系统物质和能量循环规律及高效利用技术等，是农业水土工程学科硕士、博士学位授权点和农业水土工程博士后流动工作站。 农田灌溉研究所建有灌溉技术与装备、作物灌溉、农业水资源与水环境、都市及设施农业灌溉、农村水利发展5个研究室，拥有节水高效灌溉技术与装备、非充分灌溉原理与技术、作物需水过程与调控、农业水资源优化配置与调控技术、非常规水资源安全利用、现代节水型灌区建设与改造、农田排水技术与产品7个科技创新团队。拥有河南商丘农田生态系统国家野外科学观测研究站和国家灌溉农业绿色发展联盟2个国家级科研平台；农业农村部节水灌溉工程重点实验室、作物需水过程与调控重点实验室等8个省部级平台和中国农业科学院农业水资源高效安全利用重点开放实验室等5个院级平台；拥有河南新乡、商丘、洪门三大试验基地。建有灌溉水力学试验厅、地中渗透仪试验场、作物需水量试验场等国内一流的科研基础设施。拥有“建设项目水资源论证甲级资质”，编辑出版《灌溉排水学报》。 截止2018年底，农田灌溉研究所在节水灌溉技术与设备、农业水资源合理开发与利用、农田生态环境保护等应用基础理论研究和应用技术开发方面,承担国家、省部级科研课题700余项,获得科技成果奖励173项,其中12项成果获国家级奖励, 106项成果获得省部级奖励；取得国家发明专利80余项，推广转化新技术新产品100余种。